阴茎癌若不治疗，则绝大多数患者于诊断后一年半内死亡，无5年生存，但个别报道阴茎癌不治疗的5年生存率有11.8%。治疗后5年生存率一般为60%左右。手术为当前治疗阴茎癌的有效方法之一。手术治疗后阴茎癌的5年生存率Ⅰ期为95%，Ⅱ期为67%，Ⅲ期为29%；总的5年生存率为49%~59%。根据阴茎癌的大小、侵犯深度、患者年龄以及腹股沟淋巴结转移情况等，可分别采用包皮环切术、肿瘤局部切除、阴茎部分切除、阴茎全部切除加髂腹股沟淋巴结清除等不同手术方式。
（1）包皮环切术：
适合于肿瘤位于内板，体积较小并较浅者。大多数患者有包茎或包皮过长。所以对早期患者均需要作包皮环切手术，一方面有利于明确诊断，另一方面对较小、较浅的肿瘤环切术也是治疗方法。对于需作放射治疗的病人也需作包皮环切手术，以利于治疗和观察。包皮环切术即使是施行于很早的肿瘤患者，但因为手术范围所限，其切缘距肿瘤太近，易于复发，术后如能再配合放射治疗，则可达极满意的疗效。
（2）肿瘤局部切除术：
包皮环切术也属肿瘤局部切除术的一种，其他肿瘤局部切除术仅适用于肿瘤局限于龟头或冠状沟处的浅表而小的症灶。手术局切范围必须包括肿瘤周围1~2cm的正常组织。若为了多保留阴茎，手术切缘距肿瘤太近，常不易彻底清除病变，造成术后残端肿瘤腹发或转移，反而给病人带来更大的痛苦和失去根治的机会。
（3）阴茎部分切除术：
适用于肿瘤较大，但限于阴茎龟头部的患者。离断的阴茎的平面应距肿瘤基底部2cm以上，否则，残端易于复发。
（4）阴茎全部切除术：
适用于肿瘤较大，已破坏阴茎体的大部，在肿瘤的近侧端所余正常的阴茎已不多，已不能作部分阴茎切除者。
（5）腹股沟淋巴结清除术：
阴茎肿瘤患者先取腹股沟淋巴结活检或淋巴结穿刺，当组织学或细胞学证实有转移者，则作腹股沟淋巴结清扫。若病理为阴性，则密切观察随访。若腹股沟淋巴结较大、固定，估计作清扫手术不能彻底或有困难，则应作术前放射治疗。放射后再作根治性清扫手术。
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